Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6899Q3USS0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm6899Q3USS0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms