Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Znf48Q3US17 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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