Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms