Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc33Q3ULW6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc33Q3ULW6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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