Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc177Q3UHB8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms