Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pid1Q3UBG2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms