Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms