Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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