Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms