Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Usp39Q3TIX9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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