Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam178bQ24JP3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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