Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cpne9Q1RLL3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cpne9Q1RLL3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cpne9Q1RLL3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Cpne9Q1RLL3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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