Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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