Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp2b3Q0VF55 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms