Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms