Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms