Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cntnap5cQ0V8T7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cntnap5cQ0V8T7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms