Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps8Q0P5W1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms