Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc21bQ0HA38 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc21bQ0HA38 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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