Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
F13bQ07968 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
F13bQ07968 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms