Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms