Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox12Q04890 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox12Q04890 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms