Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fgfr4Q03142 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Fgfr4Q03142 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms