Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gjb5Q02739 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gjb5Q02739 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms