Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snai1Q02085 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms