Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gja5Q01231 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms