Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms