Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms