Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Yy1Q00899 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yy1Q00899 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms