Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Apoa1Q00623 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Apoa1Q00623 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms