Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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