Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms