Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms