Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cbx1P83917 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx1P83917 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms