Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms