Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx1P80205 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms