Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ldb1P70662 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms