Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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