Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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