Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Snrpd3P62320 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms