Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp46P62069 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp46P62069 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp46P62069 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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