Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2kP61087 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms