Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhbdl3P58873 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms