Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm2P58774 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms