Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms