Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtnsP57757 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms