Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Irf5P56477 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms