Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp5P56399 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp5P56399 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp5P56399 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 295.4 ms