Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb3P54285 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms