Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SftpbP50405 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpbP50405 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms